Kiedy liście lilii wodnych są małych rozmiarów i pojawiają się na nich żółte plamy, wówczas możemy podejrzewać, że ich bulwy zostały zaatakowane przez chorobę grzybową. Inną przyczyną może być szok termiczny, który nastąpił w wyniku za zimnej wody wodociągowej. Trzecią możliwą przyczyną jest gnijące podłoże. Postępowanie zaradcze jest następujące: należy część zgniłą bulwy wyciąć, a następnie to miejsce posypać węglem drzewnym. Bulwę wsadzić w nowe miejsce o zdrowym podłożu.